甘蓝型油菜核不育系9012AB的遗传模式修正与BnRf位点的物理定位

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利用杂种优势是提高油菜产量、增强抗耐性、缓解产量与品质矛盾的重要途径。隐性细胞核雄性不育具有不育性稳定彻底,恢复源广,无负胞质效应等优点,是一种具有较大应用潜力的授粉控制系统。然而,大部分隐性核不育材料无法完全保持,制种时必须拔除母本行中约50%的可育株。因此,应用隐性核不育系在大面积制种时成本高且风险较大。上世纪90年代,9012AB类型的隐性核不育通过引入临保系产生100%不育群体,为隐性核不育系统的利用开辟了一条新的途径。目前,该系统(或相似系统)已成为我国乃至世界油菜杂种优势利用的重要途径之一。本研究在系统的遗传分析和图谱定位的基础上,修正了9012AB的育性遗传模型。在此基础上,通过比较作图实现了BnRf位点的精细定位,并最终将其定位到一个BAC克隆13.8kb的物理区间内,主要结果如下:1.9012AB类型核不育育性遗传模式的修正。通过对9012AB及其临保系T45与来源不同的几个自交系和常规品种的遗传分析,发现之前被广泛接受的三对基因(Bnms3,Bnms4,Bnrf(?)或Bnesp)控制育性的遗传模式不能合理解释9012A与DH206A杂交后代的育性分离比率。基于这一事实,对9012AB的育性遗传模式进行了修正,即雄性不育只受Bnms3和BnRf两个位点控制,显性BnMs3为野生型可育基因,隐性Bnms3为突变不育基因;而原来假定的BnMs4位点实质上是BnRfa位点的一种复等位基因型BnRfa(恢复型),该位点的另外两种基因型分别为BnRfb(不育型)和BnRfc(可育型),三者的显隐性关系为BnRfa>BbRfb>BnRfc.按照这一遗传模式,9012AB可育株基因型为BnMs3ms3RfbRfb,不育株基因型为Bnms3ms3RfbRfb;临保系基因型为Bnms3ms3RfcRfc,恢复系基因型为BnMs3Ms3或Bn__RraRfa2.BnRf复等位遗传模式的分子标记验证。在来源于(9012A×DH206A)F2中可育株与9012A回交得到的育性分离比为1:1的F2BC1株系中,鉴定出基因型为Bnms3ms3RfaRfb的可育株。在该类型可育株继续与9012A回交得到育性分离比为1:1的群体RG206AB(RG206A,Bnms3ms3RfbRgbRG206B,Bnms3ms3RfaRfb)中,筛选获得了与BnRga等位基因型连锁的13个AFLP标记和5个SSR标记。标记整合发现,5个SSR标记都被定位于A7连锁群且同时与BnRfb基因型连锁,而3个由AFLP转化而成的SCAR标记亦与BnRfb存在连锁关系。在此基础上,利用BnRfb精细定位的标记实现了BnRfa的精细定位,并将BnRfa和BnRfb共定位到标记AT3G24240与AT3G23900之间,对应拟南芥共线性区域约50kb。该结果从分子标记水平上初步证实了Rf位点复等位遗传模式的可靠性,并为该位点物理图谱的整合奠定基础。3.含BnRf位点区域的物理图谱构建。利用BnRfb共分离的分子标记AT3G23870从9012A中扩增的特异序列为探针筛选甘蓝型油菜BAC克隆文库,获得16个阳性克隆。位点两侧最近的共显性标记AT3G23900及AT3G24240对候选克隆的PCR分析表明,BAC克隆JBnB089D05和JBnB134D11最可能包含目标位点。而源于JBnB089D05两侧末端序列开发的标记BES18和BES19进一步被定位到BnRf两侧,证实该克隆包含目标基因。从该BAC克隆上获得了BnRf两侧最近标记AT3G23900与AT3G23910-1之间13.8kb的序列,预测表明其包含3个完整的ORF及2个ORF的部分片段。
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
縮略语表第10-11页
1. 文献综述第11-32页
    1.1 植物基因组学研究进展第11-14页
        1.1.1 作图群体与遗传图谱第11-12页
        1.1.2 大片段基因组文库与物理图谱第12-13页
        1.1.3 植物基因组测序概况第13-14页
    1.2 芸薹属比较基因组研究第14-17页
        1.2.1 芸薹属共线性研究第14-16页
        1.2.2 拟南芥基因组信息在芸薹属作物研究中的应用第16-17页
    1.3 植物基因克隆第17-21页
        1.3.1 基因克隆的方法第17页
        1.3.2 图位克隆的方法与策略第17-20页
        1.3.3 甘蓝型油菜图位克隆进展第20-21页
    1.4 植物雄性不育研究进展第21-25页
        1.4.1 植物雄性不育的普遍性第21-22页
        1.4.2 细胞质雄性不育研究进展第22-23页
        1.4.3 细胞核雄性不育研究进展第23-25页
    1.5 油菜隐性细胞核雄性不育研究与应用第25-31页
        1.5.1 油菜隐性细胞核雄性不育应用第26页
        1.5.2 油菜隐性细胞核雄性不育基因的定位与克隆第26-27页
        1.5.3 油菜隐性细胞核雄性不育的不育机理第27-30页
        1.5.4 分子标记辅助选育油菜隐性细胞核雄性不育系与临保系第30-31页
    1.6 本研究目的与意义第31-32页
2. 甘蓝型油菜核不育系9012AB遗传模式分析第32-42页
    2.1 前言第32-33页
    2.2 材料与方法第33-35页
        2.2.1 实验材料第33页
        2.2.2 试验方法第33-35页
    2.3 结果与分析第35-39页
        2.3.1 T45及9012A与各材料杂交后代的遗传分析第35页
        2.3.2 测交后代的遗传分析第35-36页
        2.3.3 隐性核不育系RG206AB与9012R的等位性分析第36-37页
        2.3.4 新遗传模式的设想第37-39页
    2.4 讨论第39-42页
        2.4.1 遗传模式的可靠性分析第39-40页
        2.4.2 复等位模式与三系配套第40-42页
3. Rf位点复等位遗传的分子标记验证及精细定位第42-68页
    3.1 前言第42页
    3.2 材料与方法第42-46页
        3.2.1 试验材料第42页
        3.2.2 BnRf~a定位群体的构建与育性调查第42-43页
        3.2.3 分子标记分析第43-44页
        3.2.4 BnRf~a与BnRf~a图谱整合及Rf位点精细定位第44-45页
        3.2.5 BAC克隆鉴定与目标区域测序第45页
        3.2.6 目标区间与白菜基因组比较分析第45-46页
    3.3 结果与分析第46-62页
        3.3.1 BnRf~a定位群体构建第46-47页
        3.3.2 与BnRf~a连锁的AFLP标记,SSR标记的筛选第47-51页
        3.3.3 精细定位BnRf~a及等位基因特异性标记开发第51-54页
        3.3.4 Tapidor BAC文库筛选与目标BAC确认第54-56页
        3.3.5 目标BAC测序与候选基因预测第56-58页
        3.3.6 目标区间与白菜基因组比对分析第58-62页
    3.4 讨论第62-68页
        3.4.1 9012AB的两位点育性控制模式第62-63页
        3.4.2 甘蓝型油菜图位克隆的策略第63-65页
        3.4.3 BnRf位点的分子标记在不育系与同核临保系MAS中的实用性第65-68页
参考文献第68-85页
附录第85-89页
致谢第89页
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