1、ZEB1通过诱导ER-α启动子甲基化调控乳腺癌抗雌激素治疗耐药的机理研究 2、新型VEGFR2小分子抑制剂YLL545对乳腺癌新生血管的抑制作用及其抗癌机理研究

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乳腺癌是一种雌激素依赖性肿瘤。雌激素通过与雌激素受体结合,激活特异的下游信号通路表达,刺激乳腺癌细胞的增殖,介导了乳腺癌的发生和发展。抗雌激素治疗作为乳腺癌重要的辅助治疗手段,可以明显改善患者预后。然而并不是所有乳腺癌都能采用抗雌激素治疗。对抗雌激素治疗药物的先天性耐药和获得性耐药,都可引起抗雌激素抵抗,导致治疗的失败。因此,明确抗雌激素治疗抵抗的分子机制,将极大的促进乳腺癌抗雌激素治疗的发展,提高乳腺癌患者的治疗效果,改善预后。目前已知雌激素受体ER-α表达下调或功能异常,是抗雌激素治疗耐药的主要原因。而ER-α转录表达的异常与表观遗传调节密切相关。但是ER-α表达下调的具体机制尚不完全清楚。本研究中,我们发现转录因子ZEB1可以通过招募甲基转移酶DNMT3B和去乙酰化酶HDAC1到ER-α基因启动子,促进其发生高甲基化,从而诱导乳腺癌细胞中ER-α表达下调,导致抗雌激素治疗耐药。首先,我们通过在线数据库预测分析发现,在ER-α基因启动子区存在一个大小为267 bp的Cp G岛。利用DNMT3B和HDAC1抗体行染色质免疫共沉淀实验Ch IP证明这个Cp G岛是一个潜在的差异性甲基化调控区DMR。而在我们的前期研究中发现,ZEB1与乳腺癌组织中ER-α的表达呈负相关。并且我们同样通过数据库分析发现这个Cp G岛内包含有两个ZEB1的潜在转录结合元件E2box序列。于是,我们检测了乳腺癌细胞系MDA-MB-231/SUM-159和MCF-7/ZR75-1中ER-α基因启动子甲基化程度,并且通过过表达及沉默ZEB1,从功能上证明了ZEB1对ER-α基因启动子的甲基化调控作用。接下来,我们通过体外实验中使用抗雌激素治疗的代表性药物他莫西芬(tamoxifen)和氟维司群(fulvestrant)处理乳腺癌细胞,证明了ZEB1过表达可以下调乳腺癌细胞ER-α的表达,并且降低乳腺癌细胞对抗雌激素药物的敏感性;相反地,沉默ZEB1的表达可以部分恢复ER-α的表达,并且提高乳腺癌细胞对抗雌激素药物的敏感性。机制研究证明,ZEB1可以同时与甲基转移酶DNMT3B和去乙酰化酶HDAC1在ER-α启动子上形成蛋白复合物,进而诱导DNA发生高甲基化,抑制ER-α的转录,沉默其表达。更重要的是,通过RNA干扰敲低ZEB1表达后可引起ER-α启动子的去甲基化,进而部分恢复ER-α的表达,增加乳腺癌对抗雌激素治疗的敏感性。最后,经过对乳腺癌临床标本的分析,我们发现ZEB1和ER-α的蛋白表达评分呈负相关。在乳腺癌ER-α阴性病例中,ZEB1高表达,并且与ER-α启动子高甲基化呈正相关,而在ER-α阳性性病例中,结果与之相反。在小鼠移植瘤模型中,我们进一步证明了下调ZEB1可以部分恢复ER-α的表达,并提高乳腺癌对抗雌激素治疗的敏感性。综上所述,我们的研究证明了ZEB1是介导乳腺癌抗雌激素耐药的关键因子。ZEB1及其下游信号通路可能作为乳腺癌治疗的新靶点。靶向ZEB1,并联合应用特异的表观调控抑制剂,有望成为克服乳腺癌抗雌激素治疗耐药的新策略。侵袭和转移是恶性肿瘤患者死亡的主要原因,而肿瘤血管生成是其侵袭和转移的重要因素。在肿瘤血管生成过程中,血管内皮生长因子VEGF信号通路发挥了关键的调控作用。靶向血管内皮生长因子受体VEGFR2的小分子抑制剂,作为有效的抗血管新生药物,已经广泛应用于恶性肿瘤的临床治疗。其中代表性药物为治疗晚期肾癌的小分子药物索拉非尼(sorafenib)和舒尼替尼(sunitinib)。虽然临床前研究和初期的临床实验得到了理想结果,但是随着临床的逐渐应用,发现大多数这类药物都存在一些未知的副作用,并且其疗效也需要进一步验证。因此,开发新型而低毒的VEGFR2小分子抑制剂仍然是当前研究的热点。我们在本课题中,首先以sorafenib为药物主体结构,采用计算机辅助设计,生物化学合成的方法,得到25个新型的靶向VEGFR2的小分子抑制剂。接着,以sorafenib为阳性对照,利用转基因斑马鱼(Fli-1:EGFP)模型,对这些化合物的抗血管生成作用进行筛选,得到了一种高效且低毒的VEGFR2小分子抑制剂YLL545。接下来,我们同样以sorafenib为阳性对照,用不同浓度的YLL545处理人脐静脉血管内皮细胞HUVECs。通过CCK8细胞活力实验检测发现YLL545抑制HUVECs细胞增殖的IC50为5.844μM。而进一步用Ed U细胞增殖实验检测发现,YLL545抑制HUVECs的增殖是通过减少细胞S期DNA合成导致的。此外,划痕实验和transwell实验提示YLL545可以抑制HUVECs细胞的迁移和侵袭。重要的是,成管实验和Matrigel胶塞实验证明,与sorafenib相比,YLL545能够更有效地抑制HUVECs细胞的成管能力及其在小鼠体内的血管生成作用。进而,我们需要明确YLL545抑制血管生成的分子机制。通过WB检测发现,YLL545可以明显抑制由VEGF诱导的VEGFR2磷酸化,及其下游信号调节因子的蛋白磷酸化水平,包括细胞外调节蛋白激酶ERK、信号转导子与转录激活子STAT3和雷帕霉素靶蛋白m TOR。此外,利用RT2 Profiler PCR Array,我们还发现,YLL545可以通过VEGFR2非依赖途径抑制其他血管生成相关基因的表达来影响血管生成,其中包括:FN1、TEK、ENG、THBS1和ITGAV。由于乳腺癌细胞同样表达VEGFR2、m TOR、STAT3和ERK,提示YLL545具有潜在的靶向肿瘤细胞的作用。为此,我们选择了乳腺癌细胞MDA-MB-231进行研究。通过CCK8、Ed U和平板克隆形成实验均证明了2.5μM YLL545就能明显抑制肿瘤细胞增殖,并且Annexin V和PI染色证明了YLL545还能促进MDA-MB-231细胞的凋亡。而YLL545抑制正常乳腺上皮细胞和肝上皮细胞增殖的IC50分别是35.83和33.40μM,表明YLL545对正常组织细胞的毒性甚小,其特异性抑瘤作用与细胞毒无关。最后,我们在小鼠移植瘤模型中验证了YLL545抑制血管生成的体内作用。结果显示,口服YLL545 50 mg/kg/d即可抑制乳腺癌移植瘤的血管生成,进而抑制肿瘤生长,抑制率达50%。并且与对照组相比,YLL545实验组小鼠并未出现药物毒副反应。综上所述,作为一种新型、安全、高效的血管生成小分子抑制剂,YLL545有望将来应用于肿瘤,特别是乳腺癌的治疗。
英汉缩略语名词对照(Abbreviations)第9-11页
中文摘要第11-17页
英文摘要第17-21页
论文正文一: ZEB1通过诱导ER-α 启动子甲基化调控乳腺癌抗雌激素治疗耐药的研究第22-104页
    前言第22-25页
    第一章 实验材料与方法第25-61页
        第一节 实验材料第25-33页
            1 主要仪器第25-26页
            2 实验所用细胞系第26-27页
            3 实验所用菌株第27页
            4 实验所用质粒载体第27页
            5 实验所用抗体第27-28页
            6 实验所用试剂盒第28-29页
            7 实验所用试剂及耗材第29-31页
            8 实验用动物第31页
            9 实验服务第31页
            10 实验溶液配置第31-33页
        第二节 实验方法与步骤第33-61页
            1 细胞培养第33-34页
            2 细胞计数第34页
            3 CCK8细胞活力实验第34-35页
            4 EdU细胞增殖实验第35-36页
            5 细胞克隆形成实验第36页
            6 细胞划痕实验检测细胞迁移能力第36-37页
            7 Transwell实验检测细胞侵袭能力第37页
            8 细胞总RNA的提取第37-38页
            9 组织及细胞基因组提取第38页
            10 PCR引物设计第38-40页
            11 RNA反转录成cDNA第40页
            12 Real-time PCR检测第40页
            13 RT-PCR(检测)第40-41页
            14 RT-PCR(克隆)第41页
            15电泳检测DNA条带第41-42页
            16 DNA片段切胶回收第42页
            17 DNA片段酶切第42页
            18 连接质粒载体第42-43页
            19 重组质粒转化感受态大肠杆菌第43页
            20 质粒DNA提取第43-44页
            21 重组质粒酶切鉴定第44页
            22 ER-α 启动子定点突变第44-45页
            23 shRNA设计合成第45-46页
            24 sh-pLV-RNAi vector构建第46-47页
            25 基因组DNA亚硫酸盐修饰第47-48页
            26 甲基化检测引物设计第48-49页
            27 甲基化特异性PCR第49页
            28 亚硫酸盐修饰测序PCR第49-50页
            29 HEK 293T细胞培养第50-51页
            30 质粒病毒包装第51页
            31 病毒感染第51页
            32 稳定细胞系筛选第51-52页
            33 Luciferase荧光素酶实验检测启动子活性第52页
            34 Western Blot免疫印迹第52-55页
            35 免疫沉淀IP第55页
            36 染色质免疫共沉淀ChIP第55-56页
            37 乳腺癌细胞小鼠移植瘤模型建立第56-57页
            38 移植瘤检测及小鼠组织标本处理第57页
            39 组织脱水和石蜡包埋切片第57-58页
            40 HE染色第58-59页
            41 免疫组化第59-61页
    第二章 实验结果第61-93页
        第一节 ZEB1过表达诱导乳腺癌细胞雌激素受体ER-α 启动子高甲基化并沉默其表达第61-70页
            1 乳腺癌细胞雌激素受体ER-α 启动子差异性甲基化调控区DMR预测分析第61-63页
            2 ER-α 上游转录调控因子预测分析第63页
            3 乳腺癌细胞系中ZEB1和ER-α 表达情况检测第63-65页
            4 ZEB1过表达和沉默对乳腺癌细胞ER-α 启动子甲基化的影响第65-70页
        第二节 ZEB1调控ER-α 启动子甲基化抑制其转录的机制第70-77页
            1 ZEB1抑制ER-α 启动子转录活性第70-74页
            2 ZEB1通过招募DNMT3B和HDAC1到ER-α 启动子抑制其转录第74-77页
        第三节 ZEB1与乳腺癌患者ER-α 表达及其启动子甲基化程度的关系第77-82页
            1 ZEB1在乳腺癌中的表达第77-80页
            2 乳腺癌中ZEB1表达与ER-α 启动子呈负相关第80-82页
        第四节 过表达ZEB1介导了乳腺癌细胞抗雌激素耐药第82-90页
        第五节 小鼠移植瘤模型验证ZEB1诱导抗雌激素耐药第90-93页
    讨论第93-95页
    结论第95-96页
    参考文献第96-104页
论文正文二:新型VEGFR2小分子抑制剂YLL545对乳腺癌新生血管的抑制作用及其抗癌机理研究第104-152页
    前言第104-108页
    第一章 实验材料与方法第108-121页
        第一节 实验材料第108-111页
            1 主要仪器第108页
            2 实验所用细胞第108页
            3 实验所用菌株第108页
            4 实验所用质粒载体第108-109页
            5 实验所用抗体第109页
            6 实验所用试剂盒第109页
            7 实验所用试剂及耗材第109-110页
            8 实验用动物第110页
            9 实验溶液配置第110-111页
        第二节 实验方法与步骤第111-121页
            1 斑马鱼胚胎血管发育抑制实验第111-112页
            2 斑马鱼断尾再生实验第112页
            3 斑马鱼药物毒性实验第112页
            4 小鼠Matrigel胶塞血管新生实验第112页
            5 人脐静脉血管内皮细胞HUVEC提取与培养第112-113页
            6 细胞培养第113-114页
            7 细胞计数第114页
            8 CCK8细胞活力实验第114页
            9 EdU细胞增殖实验第114页
            10 细胞划痕实验检测细胞迁移能力第114页
            11 Transwell实验检测细胞侵袭能力第114页
            12 HUVEC成管实验第114-115页
            13 流式细胞仪检测细胞凋亡第115页
            14 Western Blot免疫印迹第115页
            15 细胞热迁移实验(CETSA)第115-116页
            16 细胞总RNA的提取第116页
            17 RNA反转录成cDNA第116页
            18 电泳检测DNA条带第116页
            19 PCR引物设计第116-117页
            20 Real-time PCR检测第117页
            21 RNA array检测YLL545对HUVECs血管生成相关信号通路分子表达的影响第117-118页
            22 shRNA设计合成第118页
            23 sh-VEGFR2-p LV-RNAi vector构建第118页
            24 重组质粒转化感受态大肠杆菌第118页
            25 质粒DNA提取第118页
            26 重组质粒酶切鉴定第118页
            27 HEK 293T细胞培养第118页
            28 质粒病毒包装第118页
            29 病毒感染第118页
            30 稳定细胞系筛选第118页
            31 乳腺癌细胞小鼠移植瘤模型建立第118页
            32 移植瘤检测及小鼠组织标本处理第118-119页
            33 组织脱水和石蜡包埋切片第119页
            34 HE染色第119页
            35 免疫组化第119页
            36 冰冻切片第119-120页
            37 免疫荧光染色第120-121页
    第二章 实验结果第121-141页
        第一节 小分子抑制剂高通量筛选第121-125页
            1 小分子抑制剂设计合成第121-122页
            2 小分子抑制剂对斑马鱼胚胎血管发育的抑制作用第122-124页
            3 小分子YLL545对斑马鱼尾鳍血管再生的抑制作用第124-125页
        第二节YLL545对血管生成的抑制作用第125-129页
            1 YLL545对HUVEC细胞增殖的影响第125-126页
            2 YLL545对HUVEC细胞迁移和侵袭的影响第126-127页
            3 YLL545对HUVEC细胞成管能力的影响第127-128页
            4 YLL545影响血管生成的体内作用第128-129页
        第三节YLL545抑制血管生成的分子机制第129-133页
            1 YLL545通过VEGFR2途径抑制血管生成第129-130页
            2 YLL545通过VEGFR2非依赖途径抑制血管生成第130-133页
        第四节YLL545抑制乳腺癌细胞生长第133-137页
            1 YLL545抑制乳腺癌细胞增殖第133-134页
            2 YLL545促进乳腺癌细胞的凋亡第134-135页
            3 YLL545对正常细胞增殖的影响第135-137页
        第五节YLL545抑制乳腺癌细胞移植瘤血管生成第137-141页
            1 YLL545抑制乳腺癌细胞移植瘤生长第137-139页
            2 YLL545抑制乳腺癌细胞移植瘤血管生成第139-140页
            3 YLL545药物安全性评估第140-141页
    讨论第141-143页
    结论第143-144页
    参考文献第144-152页
文献综述一 乳腺癌内分泌治疗耐药的表观遗传调控机制第152-166页
    参考文献第157-166页
文献综述二 抗VEGF治疗与肿瘤血管新生第166-178页
    参考文献第171-178页
致谢第178-179页
攻读学位期间发表的学术论文目录第179页
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