芥菜型油菜胞质不育Hau CMS不育相关基因的鉴定及其功能分析

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细胞质雄性不育(CMS)是油菜杂种优势利用的主要途径。目前,国内外主要应用的油菜CMS系统有ogura CMS和polima CMS,其中ogura系统在欧洲应用较多,国内主要使用傅廷栋教授于1972年发现的polima胞质不育系统。然而,生产上杂交种的胞质单一化存在着潜在风险。因此,鉴定新的细胞质雄性不育类型及其胞质不育基因对于实现杂交种胞质来源多样化具有重要意义。本研究以hau CMS原始芥菜型油菜和转育的甘蓝型油菜保持系和不育系为实验材料,通过对hau胞质线粒体基因及侧翼特异区域进行序列结构及其表达,翻译分析;并进一步通过原核表达及植物遗传转化的方法,对hau胞质特异的异常开放读码框进行功能分析,鉴定hau胞质的不育相关基因。本研究的主要结果如下:1.hau胞质线粒体基因组特异区段的分析通过对不育系线粒体的功能基因侧翼序列进行染色体步移(genome walking)及序列对比分析,发现hau CMS线粒体atp6基因的下游与其芥菜型油菜保持系,甘蓝型油菜保持系存在明显差异。进一步对该区域进行BLAST分析,发现该区域可能包含一异常开放读码框(chimeric open reading frame)——orf288,与已报道的tour胞质的同源区域相似度较高(99.5%)。在所比较的序列内有四个位点的差异,hau CMS相对于tour胞质有三个碱基(485bp,785bp,802bp)的置换和一个碱基(764bp)的缺失,该开放阅读框与甘蓝型油菜油菜nap胞质线粒体orf286同源性为93%。2.hau胞质不育相关区域atp6/orf288的表达分析通过RT-PCR和northern杂交分析,证实了atp6和orf288在不育系线粒体中共转录;对orf288编码的氨基酸序列和结构进行分析,推测其编码的蛋白N端包含3个跨膜区。为了进一步验证orf288在不育系中可以翻译成蛋白,我们合成了ORF288部分氨基酸序列用于制备其特异的多克隆抗体。通过特异的多克隆抗体对不育系线粒体蛋白和花蕾总蛋白进行western杂交,结果表明orf288在hau CMS不育系中翻译成大小约32kD的蛋白。3.ORF288对大肠杆菌宿主菌具有毒害作用细胞质不育基因通过影响线粒体物质和能量代谢而导致植物雄性器官发育异常,而线粒体起源于共生在真核细胞中的细菌。因此,一些研究表明不育基因在大肠杆菌中表达,会抑制大肠杆菌的生长或对其具有致死作用。我们将orf288连入原核表达载体PET32a,在IPTG诱导下在BL21(DE3)菌株中表达。结果表明ORF288对大肠杆菌宿主细胞的增殖具有明显的抑制作用。这一结果说明orf288对大肠杆菌具有毒害作用,可能以同样的方式作用于植物线粒体,并进一步影响雄蕊发育。4.orf288的拟南芥遗传转化植株雄蕊败育为了进一步验证orf288的功能,我们构建了4个植物转化载体:(1)VNO:包含35S启动子,酵母Y187菌株coxⅣ基因的线粒体定位信号和orf288编码序列;(2)VN3:包含拟南芥AP3基因启动子,酵母Y187菌株coxⅣ基因的线粒体定位信号和orf288编码序列;(3) VNⅡ:包含拟南芥AP3启动子序列和orf288开放阅读框;(4)启动子驱动的GUS基因的载体。拟南芥转基因结果表明,VN3和VNII载体80%的转化植株表现为雄蕊败育,而VNO载体和AGUS对照载体转化植株的育性并没有变化。5.ORF288的亚细胞定位拟南芥转化实验表明,orf288在转化植株中表达能够导致植物育性的变化。其中VNⅡ载体转化植株表型与VN3一致。因此,我们推测orf288在细胞质基质中可以行使其功能或其自身可以定位到线粒体(在线粒体外表达)。通过PredSL和TargetP对ORF288氨基酸进行软件预测分析,其N端可能包含一段线粒体定位信号。为了进一步阐明orf288具有自身的线粒体定位信号,我们将其融合在GFP的N端,通过PEG介导的方法转化拟南芥原生质体,拟南芥原生质体瞬时表达结果表明,ORF288不需要外源信号肽协助就可以将自身定位到植物线粒体上。
摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第12-13页
1 文献综述第13-38页
    1.1 植物细胞质雄性不育研究的理论和实际意义第13-14页
    1.2 植物胞质雄性不育发生机理及创制第14-17页
        1.2.1 植物线粒体基因组的重组第14-15页
        1.2.2 远缘杂交及核置换第15-16页
        1.2.3 体细胞融合第16-17页
    1.3 植物细胞质雄性不育相关基因的克隆第17-25页
        1.3.1 水稻第17-18页
        1.3.2 玉米第18-20页
        1.3.3 油菜第20-23页
        1.3.4 其他植物第23-25页
    1.4 胞质不育基因的作用机理第25-31页
        1.4.1 对植物线粒体的影响第25-28页
        1.4.2 相关基因的表达差异第28页
        1.4.3 形态学及细胞学特征第28-31页
    1.5 恢复基因的作用机理第31-34页
        1.5.1 水稻第31-32页
        1.5.2 米第32页
        1.5.3 油菜第32-33页
        1.5.4 矮牵牛第33-34页
    1.6 芥菜型油菜hau CMS不育系的特征第34-37页
        1.6.1 形态学及细胞学特征第34页
        1.6.2 恢保关系第34-35页
        1.6.3 线粒体DNA特征第35-37页
    1.7 本研究的目的和意义第37-38页
2 材料和方法第38-52页
    2.1 实验材料第38页
        2.1.1 植物材料第38页
        2.1.2 载体和菌株第38页
    2.2 实验方法第38-52页
        2.2.1 油菜DNA提取第38-39页
        2.2.2 染色体步移第39-41页
        2.2.3 油菜各组织总RNA的抽提及检测第41页
        2.2.4 RT-PCR及CR-RT-PCR第41-43页
        2.2.5 Northern杂交第43-45页
        2.2.6 Western杂交第45-46页
        2.2.7 原核表达第46页
        2.2.8 植物遗传转化第46-49页
        2.2.9 亚细胞定位实验第49-51页
        2.2.10 序列分析第51-52页
3 结果与分析第52-81页
    3.1 hau CMS胞质线粒体基因组特异序列的克隆及分析第52-57页
        3.1.1 线粒体基因侧翼序列的克隆第52-53页
        3.1.2 atp6基因下游序列结构及特异性分析第53-54页
        3.1.3 atp6-orf288与其在芸薹属中的同源序列的对比分析第54-57页
    3.2 不育相关基因的表达分析第57-63页
        3.2.1 Northern杂交检测线粒体基因转录本差异第57-58页
        3.2.2 atp6/orf288的转录模式分析第58-60页
        3.2.3 atp6/orf288转录本末端序列分析第60-62页
        3.2.4 atp6/orf288转录本的编辑及其表达的组织特异性分析第62-63页
    3.3 不育胞质异常开放读码框(orf288)编码蛋白产物的分析第63-69页
        3.3.1 异常开放读码框orf288编码蛋白的结构分析第63-67页
        3.3.2 orf288编码蛋白产物的western杂交检测第67-69页
    3.4 orf288的原核表达分析第69-72页
        3.4.1 原核表达载体的构建第69-70页
        3.4.2 IPTG诱导表达第70-72页
    3.5 拟南芥和油菜的遗传转化第72-78页
        3.5.1 植物转化载体的构建第72-73页
        3.5.2 转化植株的育性鉴定第73-75页
        3.5.3 转化植株其他器官发育的异常第75-77页
        3.5.4 甘蓝型油菜的遗传转化第77-78页
    3.6 ORF288的亚细胞定位第78-81页
        3.6.1 ORF288亚细胞定位预测第78-79页
        3.6.2 瞬时表达载体的构建第79-80页
        3.6.3 ORF288的瞬时表达第80-81页
4 讨论第81-90页
    4.1 油菜hau CMS不育胞质的特异性分析第81页
    4.2 atp6/orf288转录模式分析第81-83页
    4.3 ORF288对大肠杆菌的毒害作用第83-84页
    4.4 orf288对遗传转化植株生长发育的影响第84-88页
    4.5 ORF288的亚细胞定位分析第88页
    4.6 总结与展望第88-90页
参考文献第90-104页
致谢第104-106页
附录1第106-109页
附录2第109-112页
附录3第112页
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