北美红杉和巨杉的叶绿体基因组及裸子植物系统发育研究

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论文详情
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 前言第13-21页
    1.1 叶绿体基因组研究进展第13-14页
    1.2 裸子植物系统发育关系研究进展第14-19页
        1.2.1 买麻藤目的系统进化位置第15-17页
        1.2.2 银杏的系统进化位置第17-18页
        1.2.3 北美红杉、巨杉、水杉三者的系统发育关系第18-19页
    1.3 研究内容和技术路线第19-21页
第二章 材料与方法第21-29页
    2.1 样品采集第21页
    2.2 叶绿体总DNA的提取方法第21-23页
        2.2.1 实验试剂和设备第21-22页
        2.2.2 缓冲液的配置第22页
        2.2.3 总叶绿体DNA的提取第22-23页
        2.2.4 叶绿体DNA的检测第23页
    2.3 叶绿体基因组的测序第23-25页
        2.3.1 原始数据的处理第23页
        2.3.2 叶绿体基因组的组装和检测第23-24页
        2.3.3 叶绿体基因组的注释和物理图谱的绘制第24页
        2.3.4 叶绿体基因组特征分析和比较第24-25页
    2.4 裸子植物系统发育树的构建第25-29页
        2.4.1 其它物种植物叶绿体基因组的获取第25-27页
        2.4.2 提取共有蛋白编码基因的提取第27-28页
        2.4.3 裸子植物系统发育树的构建第28-29页
第三章 结果第29-40页
    3.1 测序序列基本特征第29-30页
    3.2 叶绿体全基因组序列的基本特征第30页
    3.3 叶绿体全基因组注释结果和物理图谱第30-36页
    3.4 重复序列分析第36-37页
    3.5 反向重复区(IRA)的缺失第37页
    3.6 系统发育树的构建第37-40页
第四章 讨论第40-46页
    4.1 北美红杉和巨杉的叶绿体基因组第40-41页
    4.2 裸子植物的系统发育研究第41-46页
        4.2.1 买麻藤目的系统发育关系第41-43页
        4.2.2 银杏的系统发育关系第43-44页
        4.2.3 水杉、巨杉和北美红杉的系统发育关系第44-46页
第五章 结论和展望第46-48页
    5.1 结论第46页
    5.2 展望第46-48页
参考文献第48-57页
发表文章第57-58页
致谢第58-59页
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