甘蓝型油菜PGIP2的原核表达、蛋白功能及其遗传转化的研究

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油菜受菌核菌侵染时,菌丝必须首先要穿过渗透油菜的细胞壁,所以要分泌一系列降解细胞壁的水解酶。菌核菌分泌的第一个酶就是多聚半乳糖醛酸酶(PG),它会降解油菜细胞壁的主要成分果胶,所以PG是菌核菌重要的致病物质。而多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)可以与PG特异性结合,从而阻止油菜细胞壁的降解,所以对PGIP的研究是十分有意义的。1、本文从菌核菌侵染油菜的机理入手,根据抗菌核病甘蓝型油菜湘油15在接种菌核菌18h后会诱导pgip2基因表达增加,所以提取接种菌核菌18h湘油15的叶片的总RNA,根据甘蓝型油菜pgip2(登录号为EU142024)设计一对特异性引物,以cDNA为模板,RT-PCR扩增其CDS编码序列,应运生物学信息软件对湘油15pgip2核苷酸、氨基酸序列进行分析,并对其蛋白结构进行预测。发现其CDS序列与NCBI库(EU142024)公布的序列同源性为99.7%,其氨基酸序列与NCBI库公布的序列同源性为99.4%。发现湘油15 pgip2编码区CDS长996bp, PGIP2蛋白含331个氨基酸编码的ORF,分子量为37.1KDa,等电点为8.6。预测N端1~22个氨基酸是信号肽,且这一区域疏水性较强。具有5个N-糖基化位点,N端和C端还各具有4个参与二硫键形成的半胱氨酸残基。对其疏水性预测,发现PGIP2是一典型的疏水蛋白。其二、三级结构显示湘油15PGIP2有11个α-螺旋,12个p-延伸链,24个无规则卷曲,蛋白质凹面结构主要由β-折叠/β-转角区构成,凸面结构主要是α-螺旋。中心LRR结构域由5个串联的亮氨酸重复结构域(1 eucine-rich repeat, LRR)基序组成,是由β折叠和a螺旋通过1oop环连接,形成一个马蹄型分子。从第121个氨基酸出现且具有"xLxxLDLSxNxLTGxIPxxLxxL"序列的共同序列,是与PG结合反应的区域。这将为PGIP2蛋白的生物学功能研究提供一定的理论依据。2、将克隆的pgip2 CDS基因亚克隆到原核表达载体pET-32a (+),成功的构建了重组质粒pET-32a-pgip2。该重组质粒以pET-32a系统的起始密码子开始,包括pET-32a载体N端Trx、6×His-Tag、S-Tag和Pgip2基因的序列,C端以Pgip2基因的终止密码子终止。重组质粒转化E.coli BL21(DE3), IPTG终浓度为分别为0.5mmol/L,0.2mmol/L,温度为37℃、25℃,对其重组质粒分别诱导2h,4h,6h,8h,通过SDS-PAGE检测,在预期分子量52KDa处出现表达条带。对其进行可溶性检测,所表达的蛋白都是以包涵体的形式存在,没有可溶形式蛋白的表达。此结论为以后研究植物的Pgip基因在大肠杆菌中的原核表达提供了宝贵的参考依据。3、采用超声波破碎方法裂解包涵体pET-32a-pgip2细胞,通过低浓度变性剂的洗涤液2mol/LUrea、0.5%TritonX-100、1mmol/LEDTA进行洗涤,得到纯度较高的包涵体。再用高浓度的变性剂8mol/LUrea溶解包涵体。通过Ni2+-NTA树脂进行纯化,融合蛋白N端含6×His-Tag会结合在Ni2+柱上,经过不同浓度的咪唑洗脱,最后得到纯度较高的pET-32a-pgip2融合蛋白。纯化后的目的蛋白经Western bolt检测,结果显示,pET-32a-pgip2融合蛋白均可以与抗-His抗体发生免疫学反应,约52KDa处出现一条特异性的反应条带,更进一步的地说明pET-32a-pgip2融合蛋白在大肠杆菌中得到了正确地表达,且读码框正确。纯化的融合蛋白经过肠激酶酶切,再次经过Ni2+-NTA纯化,收集流出液得到PGIP2目的蛋白。最后通过逐渐降低透析液中尿素浓度的透析复性法对目的蛋白进行复性,得到有生物活性的PGIP2蛋白。4、通过对离体油菜叶片滴加PGIP2蛋白,再接种菌核菌菌丝来证明PGIP2蛋白可抑制菌核菌对油菜的侵染,实验显示在不同的天数里,滴加了PGIP2蛋白的叶片比对照滴加了灭菌水、PBS缓冲液的叶片,产生的病斑面积要小,且对油菜的侵害程度也轻,证明PGIP2蛋白对菌核菌侵染油菜有一定的抗性。DNS法测定PGIP2蛋白对PG的抑制作用,数据表明,随着PGIP2蛋白量的增加,PG降解多聚半乳糖醛酸生成D-半乳糖醛酸的量逐渐减少,充分证明PGIP2蛋白对PG有一定的抑制作用。琼脂糖扩散法测定PGIP2蛋白对PG的抑制作用,实验结果发现,随着PGIP2蛋白量在一定量PG里的增加,以多聚半乳糖醛酸作为底物的平板上,圆孔周围透明圈的面积逐渐变小,证明PGIP2蛋白对菌核菌产生的PG有较强的抑制作用,更进一步说明了,大肠杆菌中融合表达的PGIP2蛋白包涵体经过纯化、酶切、复性后是具有生物活性的。5、将克隆的pgip2基因,再次插入到带有CaMV35S强启动子和NOS终止子的植物表达载体pRI101-AN中,构建pRI101-pgip2超表达载体,通过农杆菌介导法转化甘蓝型油菜98c40中,经Kan抗性筛选,获得约300株左右的抗性苗。以CaMV35S启动子特异性引物,对其进行PCR检测,有34株扩增出422bp的目的条带,说明成功获得了转pgip2基因油菜。对其中4株进行半定量RT-PCR检测,发现其中有2株与非转基因植株对比,Pgip2基因表达量上调,并且对这两株油菜的离体叶片接种菌核菌菌丝进行抗性鉴定,发现转基因和非转基因油菜叶片相比,病斑面积明显比较小,受害程度也轻微。结果表明,将Pgip2基因转入了98c40体内并且能够成功的超表达,并且与非转基因对比有效的提高了抗菌核病能力。
摘要第4-7页
Abstract第7-10页
第一章 文献综述第14-35页
    1 油菜菌核病研究进展第14-19页
        1.1 菌核菌生物学特性第14-15页
        1.2 菌核菌的寄主第15页
        1.3 菌核菌对油菜的危害及症状第15页
        1.4 菌核菌的侵染方式及过程第15-16页
        1.5 菌核病的致病类物质第16-17页
        1.6 植物的抗真菌病害物质第17-19页
    2 植物抗病蛋白的研究进展第19-21页
        2.1 病程相关蛋白第19页
        2.2 抗病蛋白的结构特点第19-21页
    3 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白研究进展第21-27页
        3.1 关于国内、外研究动态第21-23页
        3.2 PGIP的结构特征第23页
        3.3 PGIP的含量、分布的差异与诱导表达第23-25页
        3.4 PGIP基因在抗病基因工程中的应用第25-27页
    4 大肠杆菌表达外源蛋白的研究进展第27-30页
        4.1 pET原核表达系统第27页
        4.2 重组蛋白在大肠杆菌中的表达第27-30页
    5 油菜转基因育种研究进展第30-35页
        5.1 油菜抗菌核病基因工程育种的研究第30-31页
        5.2 油菜转化方法的研究进展第31-33页
        5.3 油菜转基因存在的问题第33-35页
第二章 甘蓝型油菜pgip2基因的克隆及其蛋白结构预测第35-51页
    1 试验材料和方法第35-41页
        1.1 材料第35-36页
        1.2 试验方法第36-41页
    2 结果与分析第41-49页
        2.1 RNA分析第41页
        2.2 湘油15 pgip2基因分析第41页
        2.3 pgip2 TA克隆PCR检测第41页
        2.4 湘油15pgip2CDS序列的分析第41-42页
        2.5 湘油15PGIP2蛋白结构分析及预测第42-48页
        2.6 湘油15PGIP2蛋白质二级结构预测第48页
        2.7 湘油15PGIP2蛋白质三级结构预测第48-49页
    3 讨论第49-51页
        3.1 pgip2基因的诱导表达第49页
        3.2 PGIP2蛋白结构特征第49-51页
第三章 pgip2原核表达载体的构建及重组质粒pET-32a-pgip2的诱导表达第51-61页
    1 试验材料和方法第51-55页
        1.1 材料第51-52页
        1.2 试验方法第52-55页
    2 结果分析第55-59页
        2.1 重组表达质粒pET-32a-pgip2菌落PCR鉴定第55-56页
        2.2 重组表达质粒pET-32a-pgip2双、单酶切鉴定第56-57页
        2.3 pET-32a-pgip2蛋白小量诱导表达的条件优化及全菌液蛋白检测第57-58页
        2.4 pET-32a-pgip2重组蛋白的可溶性分析第58-59页
    3 讨论第59-61页
        3.1 关于pET-32a-pgip2重组质粒的构建第59页
        3.2 关于pET-32a-pgip2融合蛋白的诱导表达第59-61页
第四章 pET-32a-pgip2重组蛋白的亲和层析纯化和复性第61-71页
    1 试验材料和方法第61-65页
        1.1 试验材料第61-63页
        1.2 试验方法第63-65页
    2 结果与分析第65-68页
        2.1 pET-32a-pgip2重组蛋白纯化电泳分析第65-66页
        2.2 pET-32a-pgip2融合蛋白的Western-blotting检测第66页
        2.3 pET-32a-pgip2重组蛋白复性电泳分析第66-67页
        2.4 pET-32a-pgip2融合蛋白的蛋白浓度测定第67页
        2.5 肠激酶酶切pET-32a-pgip2融合蛋白的Trx标签及纯化第67-68页
    3 讨论第68-71页
        3.1 包涵体的破碎、洗涤和溶解第68页
        3.2 pET-32a-pgip2重组蛋白的纯化第68-69页
        3.3 pET-32a-pgip2融合蛋白的酶切第69页
        3.4 pET-32a-pgip2重组蛋白的复性第69-71页
第五章 PGIP2蛋白对菌核菌丝及菌核菌分泌多聚半乳糖醛酸酶(PG)的抑制作用第71-77页
    1 试验材料和方法第71-73页
        1.1 试验材料第71-72页
        1.2 试验方法第72-73页
    2 结果与分析第73-75页
        2.1 PGIP2蛋白对菌核菌菌丝侵染油菜叶片的抑制作用第73-74页
        2.2 DNS法测定PGIP2蛋白对PG的抑制作用第74-75页
        2.3 琼脂糖扩散法测定PGIP2蛋白对PG的抑制作用第75页
    3 讨论第75-77页
第六章 pgip2基因超表达载体的构建及转化油菜的研究第77-89页
    1 试验材料和方法第77-82页
        1.1 材料第77-79页
        1.2 试验方法第79-82页
    2 结果与分析第82-86页
        2.1 湘油巧pgipZ基因分析和AT克隆菌落PCR检测第82-83页
        2.2 重组质粒pRlllo-gPiPZ转化大肠杆菌菌落PCR检测和双酶切鉴正第83-84页
        2.3 转pgiPZ基因油菜抗性苗的获得第84页
        2.4 杭性苗油菜的PCR检测第84-85页
        2.5 转pgipZ基因油菜半定量RT-pCR检测第85页
        2.6 转pigpZ基因油菜离体叶片对菌核菌抗‘l’l鉴定分析第85-86页
    3 讨论第86-89页
        3.1 关于油菜组培的讨论第86-87页
        3.2 关于pgip2基因在98c40中的表达第87-89页
参考文献第89-101页
致谢第101-102页
作者简介第102页
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