水稻内外稃发育调控基因BLS1的图位克隆及功能分析

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水稻等禾本科植物具有与双子叶植物不同的花器官结构,典型的双子叶植物花器官从外到内依次为花萼、花瓣、雄蕊和雌蕊,水稻雄蕊和雌蕊与单子叶植物相似,而外层的内外稃和浆片是禾本科植物特有的。目前,关于水稻内外稃起源和发育的分子机理还知之甚少。本研究以从T-DNA插入突变体库和自发突变体库中获得的具有鹰嘴(beak like spikelet,bls1)表型的水稻内外稃发育突变体bls1-1与bls1-2为材料,通过图位克隆和基因功能分析,揭示了引起鹰嘴表型的遗传与分子机理,加深了我们对水稻内外稃发育分子机制的认识。主要结果如下:1. bls1突变体内外稃变小,特别是内外稃上部明显变窄、变尖,整朵小花形成类似鹰嘴的形状,而其它花器官,包括退化颖片、护颖及内部浆片、雄蕊和雌蕊的形态正常,没有发生花器官同源转化现象。石蜡切片观察发现,突变体内外稃从外到内四种类型细胞(硅化细胞、纤维状厚壁组织、薄壁细胞、未硅化细胞)都明显变小,统计未硅化细胞数目和细胞面积时发现,突变体内外稃细胞面积显著减小。扫描电镜观察发现,突变体花器官原基的起始与花器官轮生模式的形成过程正常,只是在胚珠和花粉形成期(Sp8期)内外稃不膨大,横向生长受到抑制。2.通过Real-time PCR分析,发现内外稃发育相关的花器官特征基因,包括AP1-like基因、SEP-like基因、AGL6-like基因,在突变体中的表达不受影响。由此推测,BLS1基因可能位于这些花器官特征基因下游,与突变体bls1没有发生同源转化的表型结果一致。此外,其它内外稃发育相关基因,包括REP1、DP1、DL基因在突变体中正常也表达,BLS1可能是从新的途径调控内外稃的发育。3.遗传分析表明,鹰嘴表型由一对隐性核基因控制。以bls1-1×Dular杂交组合获得的定位群体,将bls1定位在第2染色体长臂约110kb的区间内,在该区间内,bls1-1突变体大约有87kb的染色体片段缺失。再利用bls1-1等位突变体bls1-2与培矮64配置的群体进行精细定位,最终将bls1位点定位在大约65kb的区间内,bls1-2突变体在定位区间内也存在50kb染色体片段缺失。定位区间内包括7个基因,经过测序和RT-PCR表达分析发现,只有LOC_Os02g56610能够在水稻幼穗中表达,将该基因确定为候选基因BLS1。互补实验和干扰实验结果证明bls1突变体的鹰嘴表型是由BLS1基因缺失造成的。4. BLS1基因编码287个氨基酸,包含一个DUF640结构域。通过数据库搜索发现,DUF640结构域可能是陆生植物特有的。转基因植株GUS组织染色结果表明,GUS活性在幼穗中最强,特别是幼穗的内外稃,该结果与Real-time PCR基因组织特异性表达分析结果一致。瞬时表达和转基因结果都表明,BLS1蛋白定位在细胞核上。
摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第13-29页
    1.1 水稻花序的分化和发育第13-18页
        1.1.1 水稻花序发育的调控第16-18页
    1.2 水稻小穗的发育第18-27页
        1.2.1 小穗形态特征第18-19页
        1.2.2 小穗发育过程第19页
        1.2.3 小穗发育的调控第19-27页
    1.3 展望第27-28页
    1.4 本研究目的与意义第28-29页
第二章 bls1 突变体表型及细胞组织形态观察第29-40页
    2.1 材料与方法第29-32页
        2.1.1 实验材料第29页
        2.1.2 花器官形态观察和农艺性状调查第29页
        2.1.3 扫描电镜观察第29页
        2.1.4 石蜡切片实验第29-30页
        2.1.5 基因表达分析第30-32页
    2.2 结果与分析第32-39页
        2.2.1 bls1 突变体表型分析第32-33页
        2.2.2 bls1 突变体花器官形态观察第33-35页
        2.2.3 bls1 突变体内外稃细胞形态观察第35-36页
        2.2.4 bls1 突变体花器官发育时期扫描电镜观察第36-37页
        2.2.5 内外稃发育相关的同源异型基因表达分析第37-39页
    2.3 小结第39-40页
第三章 bls1 的精细定位及候选基因分析第40-49页
    3.1 材料和方法第40-42页
        3.1.1 实验材料第40页
        3.1.2 DNA 提取第40页
        3.1.3 分子标记开发和连锁标记筛选第40-41页
        3.1.4 分子标记检测第41-42页
        3.1.5 bls1 突变体缺失位点的确定第42页
        3.1.6 定位区间的基因预测及基因表达分析第42页
    3.2 结果与分析第42-48页
        3.2.1 bls1 突变体遗传分析第42-43页
        3.2.2 连锁标记筛选第43页
        3.2.3 BLS1 基因精细定位第43-46页
        3.2.4 bls1-2 缺失位点鉴定第46-47页
        3.2.5 bls1 候选基因表达分析第47-48页
    3.3 小结第48-49页
第四章 BLS1 转基因验证及功能分析第49-63页
    4.1 材料与方法第49-54页
        4.1.1 转基因受体材料第49页
        4.1.2 试剂、质粒和菌株第49页
        4.1.3 转基因载体的构建第49-52页
        4.1.4 基因的转化——农杆菌介导转化法第52-53页
        4.1.5 转基因植株鉴定第53页
        4.1.6 基因结构及同源性分析第53-54页
        4.1.7 BLS1 表达模式分析第54页
    4.2 结果与分析第54-62页
        4.2.1 转基因验证第54-56页
        4.2.2 BLS1 编码氨基酸分析第56-59页
        4.2.3 BLS1 基因表达分析第59-61页
        4.2.4 BLS1 亚细胞定位第61-62页
    4.3 小结第62-63页
第五章 全文结论与讨论第63-69页
    5.1 结论第63-64页
        5.1.1 bls1 内外稃形状改变,其他花器官正常第63页
        5.1.2 bls1 内外稃细胞变小第63页
        5.1.3 bls1 不影响内外稃发育相关的花器官特征基因表达第63-64页
        5.1.4 bls1 是染色体片段缺失突变体第64页
        5.1.5 BLS1 是一个新的植物特有蛋白第64页
        5.1.6 BLS1 表达模式与其功能相符合第64页
    5.2 讨论第64-69页
        5.2.1 BLS1 可能位于花器官特征基因下游第65页
        5.2.2 BLS1 调控外稃和内稃主体区发育第65-66页
        5.2.3 BLS1 通过内外稃发育影响籽粒形状第66-67页
        5.2.4 BLS1 与 OsMADS1 的关系第67页
        5.2.5 DUF640 基因家族功能多样性第67-69页
参考文献第69-80页
附录第80-88页
致谢第88-89页
作者简介第89页
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