水稻分子遗传图谱构建及产量相关性状QTL定位分析

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本研究利用来自日本的优质粳稻品种“月之光”和籼稻品种“明恢63”为亲本杂交(月之光×明恢63)构建了含189个家系的F2群体,建立含127个SSR标记的遗传连锁图谱。采用QTL作图软件WinQTLCartgrapher2.5对F2群体的抽穗期、株高和千粒重等产量相关性状进行了QTL定位分析,定位的QTL信息对抽穗期、株高、千粒重的遗传研究和分子标记辅助育种有重要意义,其主要研究结果如下:1.选择均匀覆盖整个水稻基因组的SSR引物701对,在两亲本间筛选到167对引物呈多态性,选择带型清晰且在基因组中分布较均匀的标记构建了一个含127个SSR分子标记的连锁图谱,使用MAPMAKER/EXP3.0构建连锁图,重组值用Kosambi函数转换成遗传图距(cM),连锁群总长度为2123.1cM,标记间平均距离为16.7cM,群体标记均匀地分布在12条染色体上。2.用复合区间定位法对水稻的抽穗期QTL进行定位,共发现4个QTLs,分布于第1、6、8、12条染色体上,表型贡献率为6.4%48.0%。3.用复合区间定位法对水稻的株高QTL进行定位,共发现4个QTLs,分布于第1、3、8、12条染色体上,表型贡献率为6.3%21.1%。4.用复合区间定位法对水稻的粒重QTL进行定位,共发现3个QTLs,分布于第1、6、8条染色体上,表型贡献率为6.2%10.3%。5. QTL研究的最终目的是将研究结果和水稻农艺性状相结合,根据水稻性状的具体特点,采取相应的实施路线,使育种更加快速有效,为水稻分子标记辅助选择育种提供了有价值的遗传信息。
摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
缩写词表第6-11页
第一章 绪论第11-25页
    1.1 分子标记的种类及应用第11-16页
        1.1.1 基于 DNA 杂交技术的标记第11-12页
        1.1.2 基于 PCR 技术的分子标记技术第12-14页
        1.1.3 新兴的分子标记技术第14-15页
        1.1.4 分子标记的应用领域第15-16页
    1.2 QTL 定位群体第16-17页
        1.2.1 初级作图群体第16-17页
        1.2.2 高级作图群体第17页
    1.3 水稻产量相关性状 QTL 研究进展第17-23页
        1.3.1 水稻抽穗期 QTL 研究进展第17-21页
        1.3.2 株高相关 QTL 研究进展第21-22页
        1.3.3 粒重相关 QTL 定位研究进展第22-23页
    1.4 论文研究的内容和意义第23-25页
        1.4.1 论文研究的内容第24页
        1.4.2 论文研究的意义第24页
        1.4.3 论文的创新点第24-25页
第二章 材料与方法第25-33页
    2.1 实验材料第25页
        2.1.1 亲本材料及种植第25页
        2.1.2 抽穗期的调查第25页
        2.1.3 株高的调查第25页
        2.1.4 千粒重的调查第25页
    2.2 DNA 的提取第25-28页
        2.2.1 主要试剂第26-27页
        2.2.2 主要仪器和设备第27页
        2.2.3 提取方法(SDS 法)第27-28页
        2.2.4 DNA 浓度检测第28页
    2.3 PCR 扩增第28-29页
    2.4 PCR 反应程序第29页
    2.5 聚丙烯酰胺凝胶配制第29-30页
    2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳第30-31页
    2.7 SSR 标记基因型数据转换第31页
    2.8 标记连锁图谱的构建和 QTL 分析第31-33页
第三章 结果与分析第33-41页
    3.1 SSR 标记连锁图谱的构建和 QTL 分析第33-35页
    3.2 亲本及 F_2群体的性状表现第35-37页
    3.3 水稻产量相关性状的 QTL 定位和效应分析第37-41页
        3.3.1 水稻抽穗期的 QTL 定位和效应分析第37-38页
        3.3.2 水稻株高的 QTL 定位与效应分析第38页
        3.3.3 水稻粒重的 QTL 定位与效应分析第38-41页
第四章 讨论第41-45页
    4.1 标记遗传图谱和 QTL 定位第41页
    4.2 抽穗期相关 QTL 的比较和利用价值第41-42页
    4.3 抽穗期和株高的相关及株高相关 QTL 的应用价值第42-43页
    4.4 粒重相关 QTL第43-45页
第五章 结论第45-47页
参考文献第47-53页
附录 AQTL 定位结果第53-57页
致谢第57-59页
攻读学位期间发表的学术论文目录第59-60页
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