水稻分子遗传图谱构建及产量相关性状QTL定位分析
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本研究利用来自日本的优质粳稻品种“月之光”和籼稻品种“明恢63”为亲本杂交(月之光×明恢63)构建了含189个家系的F2群体,建立含127个SSR标记的遗传连锁图谱。采用QTL作图软件WinQTLCartgrapher2.5对F2群体的抽穗期、株高和千粒重等产量相关性状进行了QTL定位分析,定位的QTL信息对抽穗期、株高、千粒重的遗传研究和分子标记辅助育种有重要意义,其主要研究结果如下:1.选择均匀覆盖整个水稻基因组的SSR引物701对,在两亲本间筛选到167对引物呈多态性,选择带型清晰且在基因组中分布较均匀的标记构建了一个含127个SSR分子标记的连锁图谱,使用MAPMAKER/EXP3.0构建连锁图,重组值用Kosambi函数转换成遗传图距(cM),连锁群总长度为2123.1cM,标记间平均距离为16.7cM,群体标记均匀地分布在12条染色体上。2.用复合区间定位法对水稻的抽穗期QTL进行定位,共发现4个QTLs,分布于第1、6、8、12条染色体上,表型贡献率为6.4%48.0%。3.用复合区间定位法对水稻的株高QTL进行定位,共发现4个QTLs,分布于第1、3、8、12条染色体上,表型贡献率为6.3%21.1%。4.用复合区间定位法对水稻的粒重QTL进行定位,共发现3个QTLs,分布于第1、6、8条染色体上,表型贡献率为6.2%10.3%。5. QTL研究的最终目的是将研究结果和水稻农艺性状相结合,根据水稻性状的具体特点,采取相应的实施路线,使育种更加快速有效,为水稻分子标记辅助选择育种提供了有价值的遗传信息。
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 缩写词表 | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-25页 |
| 1.1 分子标记的种类及应用 | 第11-16页 |
| 1.1.1 基于 DNA 杂交技术的标记 | 第11-12页 |
| 1.1.2 基于 PCR 技术的分子标记技术 | 第12-14页 |
| 1.1.3 新兴的分子标记技术 | 第14-15页 |
| 1.1.4 分子标记的应用领域 | 第15-16页 |
| 1.2 QTL 定位群体 | 第16-17页 |
| 1.2.1 初级作图群体 | 第16-17页 |
| 1.2.2 高级作图群体 | 第17页 |
| 1.3 水稻产量相关性状 QTL 研究进展 | 第17-23页 |
| 1.3.1 水稻抽穗期 QTL 研究进展 | 第17-21页 |
| 1.3.2 株高相关 QTL 研究进展 | 第21-22页 |
| 1.3.3 粒重相关 QTL 定位研究进展 | 第22-23页 |
| 1.4 论文研究的内容和意义 | 第23-25页 |
| 1.4.1 论文研究的内容 | 第24页 |
| 1.4.2 论文研究的意义 | 第24页 |
| 1.4.3 论文的创新点 | 第24-25页 |
| 第二章 材料与方法 | 第25-33页 |
| 2.1 实验材料 | 第25页 |
| 2.1.1 亲本材料及种植 | 第25页 |
| 2.1.2 抽穗期的调查 | 第25页 |
| 2.1.3 株高的调查 | 第25页 |
| 2.1.4 千粒重的调查 | 第25页 |
| 2.2 DNA 的提取 | 第25-28页 |
| 2.2.1 主要试剂 | 第26-27页 |
| 2.2.2 主要仪器和设备 | 第27页 |
| 2.2.3 提取方法(SDS 法) | 第27-28页 |
| 2.2.4 DNA 浓度检测 | 第28页 |
| 2.3 PCR 扩增 | 第28-29页 |
| 2.4 PCR 反应程序 | 第29页 |
| 2.5 聚丙烯酰胺凝胶配制 | 第29-30页 |
| 2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第30-31页 |
| 2.7 SSR 标记基因型数据转换 | 第31页 |
| 2.8 标记连锁图谱的构建和 QTL 分析 | 第31-33页 |
| 第三章 结果与分析 | 第33-41页 |
| 3.1 SSR 标记连锁图谱的构建和 QTL 分析 | 第33-35页 |
| 3.2 亲本及 F_2群体的性状表现 | 第35-37页 |
| 3.3 水稻产量相关性状的 QTL 定位和效应分析 | 第37-41页 |
| 3.3.1 水稻抽穗期的 QTL 定位和效应分析 | 第37-38页 |
| 3.3.2 水稻株高的 QTL 定位与效应分析 | 第38页 |
| 3.3.3 水稻粒重的 QTL 定位与效应分析 | 第38-41页 |
| 第四章 讨论 | 第41-45页 |
| 4.1 标记遗传图谱和 QTL 定位 | 第41页 |
| 4.2 抽穗期相关 QTL 的比较和利用价值 | 第41-42页 |
| 4.3 抽穗期和株高的相关及株高相关 QTL 的应用价值 | 第42-43页 |
| 4.4 粒重相关 QTL | 第43-45页 |
| 第五章 结论 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 附录 AQTL 定位结果 | 第53-57页 |
| 致谢 | 第57-59页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第59-60页 |
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