种质遗传基础狭窄是我国玉米育种的主要限制因素。在玉米地方品种蕴涵有优良基因,是玉米育种的宝贵资源。山西省地理位置特殊,大面积为山区,南北差异和垂直差异较大,它是华北平原区向西部山地、黄淮海温带作物区向高寒作物区的过渡区域,地形复杂。不同的玉米品种经过长期的驯化,形成了适应不同的生态环境的遗传丰富的玉米农家品种,是不可多得的种质资源。分析和利用山西玉米地方种质资源的遗传多样性,对扩大玉米种质基础具有重要作用。以DNA为基础的SSR分子标记技术具有许多优点诸如：操作简单,多态性高,大部分标记为共显性,对生物体的影响表现为中性,和不良性状无必然连锁,不受时间和空间的限制等优点。因此在遗传多样性分析等方面得到广泛应用。本文采用混合取样方法和SSR分子标记技术,利用均匀覆盖在玉米10条染色体上的48对引物对38个地方品种DNA样品进行PCR扩增,分析山西省38个玉米地方品种的遗传多样性及其之间的遗传关系。研究结果如下：148对引物在38个地方品种中共扩增出368个等位基因,每个SSR位点的等位基因数为2-16个,平均为7.67个；平均多态性信息量为0.76,变化范围0.24-0.89之间,第12号引物检测到等位基因数最多为16个。检测出稀有等位基因185个,占全部等位基因的50.3%；特有等位变异21个,占全部等位基因的5.7%。2几乎在所有的地方品种上检测到的等位基因数都在40个以上，如23号材料沁源白土玉米,20号材料屯留小玉茭上48对生物总共检测出的等位基因数分别为50和59个,说明这几个材料的遗传变异比较丰富。值得注意的是祁县的农家种玉米遗传多样性更加丰富,每个材料通过48对引物检测出的等何基因数都在41个以上祁县的小头白玉米和六十日及小白玉米都分别检测出47个等位基因;祁县的白马牙白洋玉米,软白玉米检测出的等位基因数分别为42,43,41个338个玉米地方品种之间的遗传相似系数在0.87到0.53之间。其中,青县小白玉米与大宁县白马牙的遗传相似系数最高为0.87,表明这两个地方品种的遗传距离较近,种质遗传基础差异比较小。沁源白马牙和和顺白玉米的遗传相似系数最小为0.53,表明这两个地方品种的遗传距离最远,种质遗传基础差异大。4根据遗传相似数矩阵,按照UPGMA进行聚类分析,得到152个混合样本SSR分析聚类图。再由152个混合样本的遗传相似系数矩阵计算出38个品种之间成对品种的平均遗传相似系数矩阵,得到38个品种的树状聚类图。
