水稻杂种优势及其相关特性的分子生物学研究--1 野败型恢复基因的分子标记研究 2 产量及其构成因素遗传效应的分子标记研究 3 叶绿体与细胞质雄性不育的分子标记研究

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人口不断增长、可利用耕地面积日益减少,导致粮食问题的艰巨性,提高水稻产量尤为重要。水稻杂种优势利用是增加稻谷产量的重要途径之一。我国杂交水稻的年种植面积达到1533~1600万hm~2,占水稻种植总面积的50%左右,产量则占稻谷总产的57%,单产达到6.60t/hm~2,比常规稻增产20%~30%(袁隆平1996 1999)。这一技术已被联合国粮农组织以及一些发展中国家作为水稻增产的关键技术。国外有关人士认为,到目前为止,还找不到一个能比杂交稻更能增产粮食的方法,现在已有20多个国家和地区引进和推广了杂交稻。杂交稻由于具有高于普通栽培稻的增产优势,自推广以来为我国水稻产量的提高发挥了极其重要的作用,为解决世界范围内的粮食危机作出了巨大贡献。 但近二十年来,杂交水稻的产量水平一直处于徘徊不前的局面。为改变这一局面,育种家们从多方面进行了艰苦的探索,然而收效甚微。生产上仍是几个当家组合长盛不衰。推测其原因可能多样性的,但与杂种优势相关特性机理研究不清是有必然联系的。 恢复基因、杂种优势、雄性不育是水稻杂种优势利用的三个重要特性,国内外对它们进行了许多的研究,取得了不少有益的结果。但也存在一些不足之处:恢复基因的遗传有多种假说,分子图谱定位还不完善,获得的分子标记还没有用于辅助育种实践;杂种优势的预测一直是育种工作者的追求,但进展缓慢;细胞质与雄性不育的研究由于受手段等影响而主要集中在线粒体上,而对叶绿体研究较少。 由于80年代后期出现的DNA分子标记可直接对作物的遗传物质进行研究,具有信息量大、覆盖面广、不受环境和作物生长发育阶段影响等优点。因此,分子标记技术的出现和迅猛发展,促进了真核生物遗传图谱的构建,定位了重要的目的基因,为基因图位克隆奠定了基础,为分子标记辅助育种提供了技术手段,为进一步深入研究水稻杂种优势及其相关特性的机理提供了可能。本研究利用分子标记技术探讨野败型恢复基因的遗传机理、杂种优势的预测、雄性不育与叶绿体的关系等,主要结果如下: 一、野败型恢复基因的分子标记研究 1、利用极大似然法和EM算法对野败型杂交籼稻恢复性的主基因进行了探测。结果表明,恢复性由两对主基因控制,两对恢复基因间表现显性上位性互作,两对基因的作用存在强弱之分,强恢复基因的加性效应是弱基因的2倍。 &8 2、选择汕优63 FZ代的高可育株和高不育株分别建立2个基因池,利用AFLP标记技术对2池问的多态性进行了研究。多数引物在基因池间未呈现多态性,只有引物组合 E-AGC/M(AA在基因池间表现多态性,用双亲、FI、FZ单株以及生产和育种上的骨干不育系与恢复系验证均表明这组引物所揭示的多态性片段与恢复基因有关(命名为 AP0oAPI为单拷贝,与恢复基因间的距离为 4,76 CM。序列测定表明,该片段为 11 sbP。 3、利用 302组SSR引物对可育与不育基因池进行了多态性分析,结果表明位于第1染色体上的RMI和位于第10染色体上的IUi258、IUi304在亲本、基因池间表现多态性,用FZ单株验证证明它们与野败型恢复基因连锁,用完全不育株分析表明与恢复基因间的遗传距离分别为l.9、2.9和0.OCM。 4、分子标记在育种上的重要应用之一便是辅助选择,利用与野败型恢复基因连锁的AFLP标记API和SSR标记IUil、RM258、Ili304对保持系、常规品种、两用系、恢复系等遗传资源以及杂交后代单株的的恢复性进行了辅助选择。结果表明,AP和IIAI在遗传资源的恢复性鉴定上具有很好的效果,而RM258和RM304由于与第10染色体上的恢复基因连锁,表现较为复杂,符合率不太高,其原因可能与第10染色体恢复基因的复杂性有关。但IUi258和Ili304在杂交后代植株的恢复性鉴定方面具有较好的效果。 二、产吕及莫构成困素邀传效应的分子标记预测 5、利用9条随机引物对42个中舢“三系”杂交稻骨干亲本(保持系和恢复系)进行了DNA遗传差异分析。结果表明:恢复系、保持系遗传多样性小。恢保间遗传一致性高达 0.87,遗传距离则为 0.1377。保持系己选育出较多的材料遗传差异超过了珍汕97B,而恢复系选育仍未突破明恢63,杂交稻遗传差异未明显大于汕优63。双亲遗传差异小是产量徘徊的重要原因,限制因素在于恢复系的选育。 6、利用 57个 KAPD引物和 15个 AFLP引物分析了明恢 63与珍汕 97A之间 1209个位点的杂合性。结果表明,57个 RAPD引物能扩增出 394条带,平均每个引物扩增69条,多态性带1二9条,汕优63的杂合性为3二尸4%;15组AFLP引物共扩增出815个位点,平均每组引物扩增54.33条,多态性带289条,汕优63的杂合性为35.46O。1209个位点显示汕优63的杂合性为34.57O。 7、利用 AFLP、MPD、SSR技术分析了 10个恢复系和 5个不育系的 9引个位点,利用15个亲本配制了SO个杂交组合,在沪州和重庆两个环境下同时种植,考察了
中文摘要第10-13页
英文摘要第13页
第一部分 文献综述第28-65页
    第1章 DNA标记技术及其应用第28-41页
        1.1 遗传标记及其发展第29-31页
        1.2 主要分子标记技术的原理第31-34页
            1.2.1 RFLP第31页
            1.2.2 AFLP第31-33页
            1.2.3 SSR第33-34页
        1.3 分子标记技术在育种上的应用第34-41页
            1.3.1 基因定位第34-35页
                1.3.1.1 质量性状基因定位第34页
                1.3.1.2 数量性状基因定位第34-35页
            1.3.2 种质资源的鉴定第35-36页
            1.3.3 亲本评价及优势选配第36页
            1.3.4 分子标记辅助育种第36-40页
                1.3.4.1 杂交后代目的基因的跟踪选择第36-37页
                1.3.4.2 回交后代导入有利基因第37-40页
            1.3.5 建立核心品种的指纹图谱第40-41页
    第2章 野败型杂交水稻质核互作雄性不育恢复基因的遗传机理研究进展第41-49页
        2.1 育性指标第42-45页
            2.1.1 育性指标的选择第42-43页
                2.1.1.1 花粉育性第42-43页
                2.1.1.2 开放结实率第43页
                2.1.1.3 套袋结实率第43页
                2.1.1.4 遗传结实率第43页
                2.1.1.5 基本结实率第43页
            2.1.2 育性标准的划分第43-45页
        2.2 恢复基因数目第45-47页
            2.2.1 单基因遗传第45-46页
            2.2.2 数量性状遗传第46页
            2.2.3 阀性状假说第46页
            2.2.4 双基因遗传第46-47页
        2.3 恢复基因的等位性第47页
        2.4 恢复基因的定位第47-49页
            2.4.1 三体定位第47-48页
            2.4.2 分子图谱定位第48-49页
    第3章 杂种优势遗传机理及其预测第49-60页
        3.1 杂种优势现象的发现及其利用第50页
        3.2 杂种优势的遗传基础第50-53页
            3.2.1 显性效应与杂种优势第51页
            3.2.2 超显性效应与杂种优势第51-52页
            3.2.3 上位性效应与杂种优势第52页
            3.2.4 基因表达与杂种优势第52-53页
            3.2.5 基因网络与杂种优势第53页
        3.3 杂种优势的预测第53-60页
            3.3.1 基于数量遗传的杂种优势预测第54-56页
                3.3.1.1 配合力法第54页
                3.3.1.2 遗传距离法第54页
                3.3.1.3 杂种优势群法第54-55页
                3.3.1.4 测交法第55-56页
                3.3.1.5 加性-显性模型、种子模型预测法第56页
            3.3.2 基于生理生化的杂种优势预测第56-57页
                3.3.2.1 叶绿体互补法第56页
                3.3.2.2 线粒体互补法第56页
                3.3.2.3 细胞匀浆法与ATP含量法第56页
                3.3.2.4 同工酶法第56-57页
                3.3.2.5 细胞核行为和DNA含量法第57页
                3.3.2.6 其它方法第57页
            3.3.3 基于DNA水平的预测第57-60页
    第4章 细胞器与雄性不育第60-65页
        4.1 线粒体与雄性不育第61-63页
        4.2 叶绿体与雄性不育第63-64页
        4.3 线粒体、叶绿体、细胞核间遗传信息的交流第64-65页
第二部分 导言第65-77页
    第5章 研究的目的意义第65-70页
        5.1 野败型恢复基因的分子标记研究的重要意义第66-67页
        5.2 产量及其构成因素遗传效应的分子标记研究的重要意义第67-68页
        5.3 叶绿体与细胞质雄性不育的分子标记研究的重要意义第68-70页
    第6章 试验设计与技术路线第70-77页
        6.1 野败型恢复基因的分子标记研究技术路线第71-73页
        6.2 产量及其构成因素遗传效应的分子标记研究技术路线第73-75页
        6.3 叶绿体与细胞质雄性不育的分子标记研究技术路线第75-77页
第三部分 野败型恢复基因的分子标记研究第77-116页
    第7章 利用极大似然法分析野败型杂交籼稻恢复基因的遗传第77-89页
        7.1 材料与方法第78-86页
            7.1.1 供试材料及田间试验第78页
            7.1.2 统计分析第78-86页
                7.1.2.1 分布模型与极大似然估计第78-81页
                7.1.2.2 F_2世代主基因及其互作的遗传假设和需要估计的参数第81-83页
                7.1.2.3 遗传假设的似然比测验第83-86页
        7.2 结果与分析第86-88页
            7.2.1 基因对数检测第86页
            7.2.2 两对主基因互作分析第86页
            7.2.3 两对主基因的遗传效应第86-88页
        7.3 讨论第88-89页
            7.3.1 关于育性标准的划分第88页
            7.3.2 关于恢复基因的数目第88页
            7.3.3 关于恢复基因的效应第88-89页
    第8章 野败型杂交水稻恢复基因的AFLP标记研究第89-99页
        8.1 材料与方法第90-91页
        8.2 结果与分析第91-97页
            8.2.1 明恢63与珍汕97A间的多态性第92页
            8.2.2 与恢复基因相关的分子标记筛选第92-93页
            8.2.3 特征片段的验证第93-94页
                8.2.3.1 特征片段的双亲验证第93页
                8.2.3.2 特征片段的恢复系、不育系验证第93-94页
                8.2.3.3 特征片段的F_2单株验证及与恢复基因间的分子图谱距离第94页
            8.2.4 特征片段的回收纯化及Southern杂交第94-95页
            8.2.5 特征片段的克隆第95-97页
            8.2.6 特征片段的序列测定第97页
        8.3 讨论第97-99页
    第9章 利用SSR标记定位明恢63的2对恢复基因第99-106页
        9.1 材料与方法第100页
        9.2 结果与分析第100-104页
            9.2.1 亲本的SSR多态性分析第101页
            9.2.2 明恢63 2对恢复基因的定位第101-103页
            9.2.3 第10号染色体短臂上的SSR分析第103-104页
        9.3 讨论第104-106页
    第10章 野败型恢复基因的分子标记辅助育种研究第106-116页
        10.1 材料与方法第107页
        10.2 结果与分析第107-114页
            10.2.1 利用AP_1筛选恢复系、不育系的研究第107-108页
            10.2.2 利用RM1鉴定种质资源的恢复基因第108-109页
            10.2.3 利用RM258鉴定种质资源的恢复基因第109页
            10.2.4 利用RM304鉴定种质资源的恢复基因第109-113页
            10.2.5 RM1、RM258、RM304对杂交后代单株恢复基因进行鉴定的研究第113-114页
        10.3 讨论第114-116页
第四部分 水稻产量及其构成因素遗传效应的分子标记研究第116-169页
    第11章 我国中籼杂交稻亲本的DNA变异性研究第116-124页
        11.1 材料与方法第117-119页
        11.2 结果与分析第119-121页
            11.2.1 亲本间的多态性第119页
            11 2.2 恢复系和保持系的群体杂合性第119-120页
            11.2.3 遗传一致性和遗传距离第120页
            11.2.4 恢复系与保持系的遗传分类第120页
            11.2.5 恢复系、保持系的平均杂合性第120-121页
            11.2.6 恢×保遗传差异超过汕优63的组合分析第121页
        11.3 讨论第121-124页
            11.3.1 恢复系、保持系遗传基础匮乏第121-122页
            11.3.2 杂交稻组合遗传差异小第122页
            11.3.3 亚种间杂种优势利用势在必行第122-124页
    第12章 汕优63杂合性的RAPD和AFLP分析第124-129页
        12.1 材料与方法第125页
        12.2 结果与分析第125-128页
            12.2.1 AFLP和RAPD扩增的位点数第126-128页
            12.2.2 汕优63的DNA杂合性第128页
        12.3 讨论第128-129页
    第13章 分子标记与产量及其构成因素杂种优势的相关性第129-142页
        13.1 材料与方法第130-132页
        13.2 结果与分析第132-141页
            13.2.1 亲本多态性分析第132-134页
            13.2.2 阳性标记和增、减效标记的筛选第134页
            13.2.3 所有标记遗传差异与杂种优势的关系第134-139页
            13.2.4 阳性标记遗传差异与杂种优势的关系第139页
            13.2.5 增、减效标记遗传差异与杂种优势的关系第139-140页
            13.2.6 非环境型标记遗传差异与杂种优势的关系第140-141页
        13.3 讨论第141-142页
    第14章 分子标记与产量及其构成因素的相关性第142-150页
        14.1 材料与方法第143页
        14.2 结果与讨论第143-150页
            14.2.1 阳性标记和增、减效标记的筛选第143页
            14.2.2 所有标记遗传差异与产量及其构成因素的关系第143页
            14.2.3 阳性标记遗传差异与产量及其构成因素的关系第143-144页
            14.2.4 增、减效标记遗传差异与产量及其构成因素的关系第144页
            14.2.5 非环境型标记遗传差异与产量及其构成因素的关系第144-150页
    第15章 分子标记与产量及其构成因素对照优势的相关性第150-158页
        15.1 材料与方法第151页
        15.2 结果与讨论第151-158页
            15.2.1 阳性标记和增、减效标记的筛选第151页
            15.2.2 所有标记遗传差异与对照优势的关系第151页
            15.2.3 阳性标记遗传差异与对照优势的关系第151-152页
            15.2.4 增、减效标记遗传差异与对照优势的关系第152页
            15.2.5 非环境型标记遗传差异与对照优势的关系第152-158页
    第16章 分子标记与产量及其构成因素显性效应的相关性第158-169页
        16.1 材料与方法第159页
        16.2 结果与讨论第159-169页
            16.2.1 性状遗传模型检测第159-160页
            16.2.2 阳性标记和增、减效标记的筛选第160页
            16.2.3 所有标记遗传差异与显性效应的关系第160页
            16.2.4 阳性标记遗传差异与显性效应的关系第160-161页
            16.2.5 增、减效标记遗传差异与显性效应的关系第161页
            16.2.6 非环境型标记遗传差异与显性效应的关系第161-169页
第五部分 叶绿体与细胞质雄性不育的分子标记研究第169-181页
    第17章 水稻质核互作雄性不育系珍汕97A、B的AFLP分析第169-174页
        17.1 材料与方法第170页
        17.2 结果与分析第170-173页
            17.2.1 珍汕97不育系与保持系总DNA的AFLP分析第170-171页
            17.2.2 珍汕97不育系与保持系间cpDNA、mtDNA的AELP分析第171-172页
            17.2.3 差异片段A_1和B_1的DNA序列测定及同源性分析第172-173页
        17.3 讨论第173-174页
    第18章 4种不同胞质来源CMS叶绿体特异区段的DNA序列及特异区段在常用保持系、恢复系中的分布第174-181页
        18.1 材料与方法第175页
        18.2 结果与分析第175-180页
            18.2.1 4种不同细胞质来源的不育系、保持系特异区段序列测定第175-176页
            18.2.2 特异区段在不育系、保持系间的分布第176-178页
            18.2.3 特异区段在恢复系间的分布第178-180页
        18.3 讨论第180-181页
致谢第181-184页
参考文献第184-204页
附录A 主要仪器和试剂第204-206页
附录B 文中缩写第206-207页
附录C 学习期间撰写和发表的论文第207-210页
附录D 作者简介第210页
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