酸枣种质资源遗传多样性分析及其核心种质的构建

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酸枣(Ziziphus jujuba var.spinosa(Bunge)Hu ex H.F.Chow)是我国重要的野生资源之一,为枣属中抗性最强的种群,同时具有很高的研究价值,是我国重要的可利用宝贵资源。本研究以不同种源地酸枣资源共367份种质为试材,分析了酸枣资源数量性状和质量性状的变异情况;从形态学方面揭示各酸枣种质的遗传背景,并结合SSR分子标记研究各酸枣种质的遗传多样性及亲缘关系,共同构建了酸枣资源的核心种质;为酸枣砧木的培育、优异种质资源的挖掘及种质资源保存利用提供科学依据。对367份酸枣种质直刺长度、二次枝节数、枣吊长度、叶片面积、花径、单果重、果形指数、单核重、可食率等52个数量性状和针刺状态、叶片形状、叶片颜色、果实形状、果实风味、核形、核纹等17个质量性状的变异情况进行统计,数量性状变异幅度范围在0.52%~54.44%(花径大小~淀粉含量)之间,遗传多样性指数在1.465~2.259(可食率~锯齿宽度);质量性状中频率统计在0%~96.28%不等,遗传多样性指数在0.251~2.443之间。不同种源地酸枣资源数量性状差异明显,遗传多样性指数大小依次为阿拉尔(1.877)>阿克苏>内蒙古>山东>山西>河北>陕西(1.087);质量性状中差异也较为显著,遗传多样性指数依次为阿克苏(1.345)>山东>内蒙古>山西>陕西>阿拉尔>河北(1.006)。采用主成分分析法对各数量性状进行分析,得到五个主成分因子,因子中果实色光值、单核重、果核横径、可溶性糖含量、雄蕊长度、叶片亮度、叶片长、叶片宽等25个性状能较好的反应各性状间的差异,累计贡献率达82.046%。采用四种聚类方法对数量性状进行分析,最终确定可变类平均法最合适,酸枣形态学上的表现说明其具有丰富的遗传多样性.。对155份酸枣种质进行性研究,11个SSR位点上,各位点检测等位基因数在3~6个,共检测46个等位基因,平均每个位点4.18个,长度152~238bp之间。平均有效等位基因数3.1851、平均期望杂合度为0.3732、Shannon’s信息指数为1.2275,表明酸枣种质遗传多样性较丰富。种质群体间的遗传多样性中山西的酸枣种质资源香农指数最高,为1.1369,其次是阿拉尔1.1163,遗传多样性最低的是陕西为1.0275。采用聚类取样法和随机取样法并结合SSR分子标记结果构建55份酸枣资源核心种质,取样比例为20.4%。核心种质初步检验中,平均值符合率、标准差符合率和变异系数符合率分别为98.48%、95.24%、95.80%,利用SPSS对候选种质进行t检验,等位基因数、有效等位基因数、Shannon’s信息指数和Nei’s多样性的保留率分别为95.65%、96.87%、97.33%和99.02%,说明构建的核心种质具有很好的代表性。
摘要第4-6页
Abstract第6-7页
缩略符号(Abbreviation)第11-12页
前言第12-14页
第1章 文献综述第14-22页
    1.1 遗传多样性的研究进展第14-17页
        1.1.1 遗传多样性的研究概念与意义第14页
        1.1.2 遗传多样性分析方法研究第14-16页
            1.1.2.1 形态学研究第14-16页
            1.1.2.2 孢粉学研究第16页
            1.1.2.3 DNA分子标记第16页
        1.1.3 分子标记在枣遗传多样性中应用第16-17页
    1.2 SSR分子标记在植物多样性中的应用第17-18页
    1.3 核心种质的建立第18-20页
        1.3.1 核心种质数据来源第18页
        1.3.2 核心种质取样方法和比例第18-19页
        1.3.3 核心种质的检验与评价第19-20页
    1.4 技术路线第20-21页
        1.4.1 酸枣种质资源总体技术路线第20-21页
        1.4.2 SSR分子标记的流程第21页
    1.5 本研究目的及意义第21-22页
第2章 酸枣种质资源遗传多样性分析第22-70页
    2.1 材料与方法第22-25页
        2.1.1 试验材料与仪器设备第22页
            2.1.1.1 供试材料第22页
            2.1.1.2 仪器设备第22页
        2.1.2 试验方法第22-25页
            2.1.2.1 各指标调查方法及标准第22-25页
            2.1.2.2 表型性状的变异系数、遗传多样性指数与聚类第25页
    2.2 结果与分析第25-67页
        2.2.1 酸枣各数量性状的分布情况第25-36页
        2.2.2 各数量性状的分级情况第36-38页
        2.2.3 数量性状的统计分析第38-41页
        2.2.4 酸枣质量性状变异统计第41-43页
        2.2.5 不同种源地酸枣种质资源各性状遗传多样性的差异比较第43-49页
            2.2.5.1 不同种源地酸枣种质资源数量性状遗传多样性变异分析第43-47页
            2.2.5.2 不同种源地酸枣种质资源香农多样性指数分析第47-49页
        2.2.6 酸枣各数量性状的相关性分析第49-58页
        2.2.7 各酸枣种质的聚类分析和亲缘关系的研究第58-67页
            2.2.7.1 数量性状的主成分分析第58-61页
            2.2.7.2 各酸枣资源的亲缘关系分析第61-67页
    2.3 讨论第67-69页
        2.3.1 酸枣资源形态学性状分布及变异情况第67-68页
        2.3.2 酸枣资源多样性分析及亲缘关系探讨第68-69页
    2.4 结论第69-70页
第3章 酸枣种质资源的遗传多样性SSR标记分析第70-82页
    3.1 实验材料第70-71页
        3.1.1 材料第70页
        3.1.2 仪器和试剂第70-71页
            3.1.2.1 仪器设备第70-71页
            3.1.2.2 主要试剂第71页
    3.2 实验方法第71-73页
        3.2.1 DNA提取与引物筛选第71-72页
            3.2.1.1 DNA提取中试剂的配置第71页
            3.2.1.2 DNA的提取方法第71-72页
        3.2.2 PCR反应体系的建立第72页
        3.2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳第72-73页
            3.2.3.1 试剂的配置第72-73页
            3.2.3.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳的程序第73页
            3.2.3.3 银染显色程序第73页
        3.2.4 SSR引物第73页
        3.2.5 SSR分子标记遗传多样性分析第73页
    3.3 结果与分析第73-79页
        3.3.1 DNA的电泳检测第73-74页
        3.3.2 SSR标记分析第74页
        3.3.3 SSR标记遗传多样性分析第74-76页
        3.3.4 酸枣种质资源的聚类分析第76-79页
            3.3.4.1 群体间聚类分析第76-77页
            3.3.4.2 酸枣种质资源间聚类分析第77-79页
    3.4 讨论第79-80页
    3.5 结论第80-82页
第4章 酸枣种质资源核心种质的构建第82-94页
    4.1 材料与方法第82页
        4.1.1 实验材料第82页
        4.1.2 核心种质构建方法第82页
        4.1.3 核心种质检验第82页
    4.2 结果与分析第82-91页
        4.2.1 核心种质的选择第82-86页
        4.2.2 核心种质的检验第86-91页
    4.3 讨论第91-93页
        4.3.1 不同数据来源构建种质资源核心种质第91-92页
        4.3.2 不同取样方法对构建核心种质影响第92页
        4.3.3 不同取样比例对构建核心种质影响第92-93页
        4.3.4 核心种质的代表性和多样性第93页
    4.4 结论第93-94页
参考文献第94-103页
附录第103-107页
致谢第107-108页
作者简介第108页
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