兔GHR基因第10外显子多态性及其与部分生产性状的关联研究

本实验以比利时兔、天府黑兔、齐卡兔、哈白兔及加利福尼亚兔共220只肉兔为试验材料,采用单链构象多态性(PCR-SSCP)技术,研究了兔GHR基因第10外显子的SNPs及其与生产性能的相关性。结果如下:SCCP分析表明,在5个肉兔品种中引物1扩增片段都发现了A、B 2个等位基因,其频率分别为0.6386和0.3614,AA、AB、BB 3种基因型频率分别为0.4273、0.4227和0.15;引物2扩增片段都发现了M、N 2个等位基因,其频率分别为0.6227和0.3773,MM、MN、NN 3种基因型频率分别为0.4364、0.3727和0.1909。进一步测序表明,引物1扩增片段多态性位点由705bp处T→C突变造成,引物2扩增片段多态性位点由810bp处C→T突变造成。2个位点都属于中度多态,PIC分别为0.3471和0.3205。不同肉兔品种生产性状最小二乘分析表明,品种效应对于活重、全净膛、屠宰率、熟肉率、料肉比等生产性状影响很大,其中天府黑兔的活重、全净膛、屠宰率的最小二乘均值显著高于其它4个品种;哈白兔的熟肉率的最小二乘均值显著高于比利时兔;对于料肉比而言,哈白兔最小二乘均值显著低于齐卡兔,与其他三个品种差异不显著。基因型与生产性状的相关性分析表明,705 SNP位点中基因型AA的活重、全净膛、屠宰率、熟肉率最小二乘均值都显著高于基因型BB(P＜0.05);810 SNP位点中基因型MM的活重、全净膛、屠宰率、熟肉率最小二乘均值都显著高于基因NN(P＜0.05)。705 SNP和810 SNP两位点9种基因型组合的料肉比、屠宰率最小二乘均值差异均不显著;基因型组合ABNN的活重最小二乘均值都显著高于基因型组合AANN、BBMM(P＜0.05);基因型组合AAMM、ABNN、BBMN的全净膛最小二乘均值与基因型组合BBMM差异显著(P＜0.05),而与其它基因型组合最小二乘均值差异不显著;基因型组合AANN、ABMM、BBMN的熟肉率最小二乘均值都显著高于基因型组合BBMM(P＜0.05)。因此可考虑将GHR基因外显子10可作为影响兔部分生产性状的候选基因。